Parameterized Algorithm of the Individual Haplotyping MSR Problem with Mate-Pairs
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
the algorithm for solving the inverse numerical range problem
برد عددی ماتریس مربعی a را با w(a) نشان داده و به این صورت تعریف می کنیم w(a)={x8ax:x ?s1} ، که در آن s1 گوی واحد است. در سال 2009، راسل کاردن مساله برد عددی معکوس را به این صورت مطرح کرده است : برای نقطه z?w(a)، بردار x?s1 را به گونه ای می یابیم که z=x*ax، در این پایان نامه ، الگوریتمی برای حل مساله برد عددی معکوس ارانه می دهیم.
15 صفحه اولOn the Complexity of the Single Individual SNP Haplotyping Problem
We present several new results pertaining to haplotyping. These results concern the combinatorial problem of reconstructing haplotypes from incomplete and/or imperfectly sequenced haplotype fragments. We consider the complexity of the problems Minimum Error Correction (MEC) and Longest Haplotype Reconstruction (LHR) for different restrictions on the input data. Specifically, we look at the gapl...
متن کاملthe problem of divine hiddenness
این رساله به مساله احتجاب الهی و مشکلات برهان مبتنی بر این مساله میپردازد. مساله احتجاب الهی مساله ای به قدمت ادیان است که به طور خاصی در مورد ادیان ابراهیمی اهمیت پیدا میکند. در ادیان ابراهیمی با توجه به تعالی خداوند و در عین حال خالقیت و حضور او و سخن گفتن و ارتباط شهودی او با بعضی از انسانهای ساکن زمین مساله ای پدید میاید با پرسشهایی از قبیل اینکه چرا ارتباط مستقیم ویا حداقل ارتباط وافی به ب...
15 صفحه اولPolynomial and APX-hard cases of the individual haplotyping problem
SNP haplotyping problems have been the subject of extensive research in the last few years, and are one of the hottest areas of Computational Biology today. In this paper we report on our work of the last two years, whose preliminary results were presented at the European Symposium on Algorithms (Proceedings of the Annual European Symposium on Algorithms (ESA), Vol. 2161. Lecture Notes in Compu...
متن کاملProbabilistic single-individual haplotyping
MOTIVATION Accurate haplotyping-determining from which parent particular portions of the genome are inherited-is still mostly an unresolved problem in genomics. This problem has only recently started to become tractable, thanks to the development of new long read sequencing technologies. Here, we introduce ProbHap, a haplotyping algorithm targeted at such technologies. The main algorithmic idea...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Journal of Software
سال: 2007
ISSN: 1000-9825
DOI: 10.1360/jos182070